沉船方舟是一个重要的探索区域，位于暮土右侧的遗忘方舟内。玩家需要从暮土初始区域向右飞行，找到黑色旗杆附近的小船，坐下后等待动画传送即可抵达。沉船区域包含六个先祖和六种光芒收集任务，先祖分布在船头、船体和船尾的特定位置。沉船内部还隐藏着三个光之翼和一个冥想点，这些都可以作为游戏中的基础装备来提升角色能力。
完成先祖任务可以解锁独特的装扮奖励，例如流苏斗篷和紫色头巾，这些都需要用任务积累的爱心和蜡烛进行兑换。先祖1和先祖6位于船头区域，先祖3在船体上方的大坑中，先祖2和4在船尾上方的小山上，先祖5则位于船尾后方大石头的角落。这些装扮不仅外观独特，还能通过魔法商店进一步定制。
魔法商店位于沉船下方，靠近中央桌子处，提供限时体型重塑药水和永久体型重塑魔法等高级道具。玩家需要消耗蜡烛或爱心来兑换这些装备，体型重塑类道具会立即生效，改变角色外观，提升游戏的个性化体验。
沉船方舟的六种光芒收集任务包括红色光芒在沉船后方田地、蓝色光芒在霞谷溜冰场水下、青色光芒在云野入口后方云层中、绿色光芒在云野浮岛图、紫色光芒在禁阁双人门隐藏图以及橙色光芒在雨林栈桥图左侧树林。收集这些光芒后返回向导先祖提交，可以获得爱心奖励，并逐步解锁场景变化，从荒芜向绿洲转化。
当玩家完成所有光芒收集和先祖任务后，遗忘方舟会恢复生态，解锁魔法罐子，每天可以免费领取随机魔法，这些魔法道具能临时或永久改变角色属性，增加游戏策略性。
沉船图内分布着光之翼和冥想点，冥想点位于黑水港湾沉船甲板，完成冥想任务需要解锁特定先祖节点，从而获得特殊奖励。这些装备的获取过程需要玩家探索不同地图，利用地形和道具来优化收集效率。
